利用 AOTF 近紅外光譜儀檢測(cè)中藥中微生物的方法

利用 AOTF 近紅外光譜儀檢測(cè)中藥中微生物的方法

 

摘?? 要??? 本文采用 AOTF 近紅外光譜技術(shù)以漫反射方式對(duì)新癀片中的微生物即細(xì)菌和霉菌進(jìn) 行光譜掃描,分別建立了偏最小二乘法(PLS1)回歸模型和主成分分析模型。通過(guò)偏最小二 乘法(PLS1),建立了菌體數(shù)量的回歸模型,并探討了菌體數(shù)量梯度對(duì)模型預(yù)測(cè)結(jié)果的影響, 最終確定了以多模型分步快速菌檢法的預(yù)測(cè)方法。通過(guò)主成分分析模型,結(jié)果顯示 AOTF 技 術(shù)建立的數(shù)學(xué)模型不僅能夠分辨出樣品中的菌體數(shù)量是否合格,還能夠?qū)w是否具有活性 進(jìn)行定性。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,AOTF-NIR Luminar 5030 光譜儀利用使用光譜數(shù)據(jù)和校準(zhǔn)模型, 能夠快速準(zhǔn)確地對(duì)新癀片中的菌體進(jìn)行定量分析和定性分析。

主題詞?? 聲光可調(diào)濾光器;近紅外光譜;微生物;偏最小二乘法(PLS1)

在中藥制藥行業(yè),對(duì)細(xì)菌等微生物的的檢測(cè)按照國(guó)家藥典的規(guī)定是必須進(jìn)行的一項(xiàng)檢測(cè) 項(xiàng)目,常規(guī)的檢測(cè)方法是利用培養(yǎng)基培養(yǎng)計(jì)數(shù)的方式來(lái)進(jìn)行檢測(cè)[1],該方法操作復(fù)雜、費(fèi)時(shí) 費(fèi)力,至少需要 48 小時(shí)才能得到最終的檢測(cè)結(jié)果,不能夠保持一個(gè)流暢的生產(chǎn)過(guò)程。如何 尋找一種快速的檢測(cè)方式,能夠迅速得到檢驗(yàn)結(jié)果,對(duì)中藥制藥行業(yè)的生產(chǎn)具有重大的意義。 近幾年在中國(guó)興起的近紅外檢測(cè)技術(shù),作為一門(mén)獨(dú)立的分析檢測(cè)技術(shù)具有不需要樣品的預(yù)處 理,檢測(cè)速度快(秒級(jí)速度),不消耗試劑、綠色環(huán)保分析等特點(diǎn),符合菌檢快速檢測(cè)的要 求,但是,能否利用近紅外技術(shù)對(duì)細(xì)菌等微生物進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確度如何?以往從 未見(jiàn)此方面的論文或報(bào)道。鑒于此,我們利用美國(guó) Brimrose 公司的 Luminar 5030 型便攜式 AOTF 技術(shù)近紅外光譜儀對(duì)廈門(mén)中藥廠(chǎng)有限公司提供的 20 個(gè)樣品進(jìn)行光譜采集,建立模型并 預(yù)測(cè),以考察 AOTF-NIR 技術(shù)能否在菌檢項(xiàng)目中成功應(yīng)用。聲光可調(diào)濾光器(Acousto-optic tunable filter,簡(jiǎn)稱(chēng) AOTF)是基于各向異性的雙折射晶體的聲光衍射原理,利用超聲波 與特定的晶體作用而產(chǎn)生分光的光電器件[2,3,4]。與傳統(tǒng)的基于機(jī)械調(diào)諧分光元件的光譜儀器 相比,以 AOTF 作為分光元件的光譜儀具有明顯的優(yōu)越性:它結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,光學(xué)系統(tǒng)無(wú)移動(dòng)性 部件,體積小,集光能力強(qiáng),最吸引人之處在于它的掃描速度快、信噪比高[5]。

1. 實(shí)驗(yàn)部分

1.1 ?儀器條件和樣品處理

儀器:美國(guó) BRIMROSE 公司產(chǎn)的 Luminar 5030 型便攜式 AOTF 技術(shù)近紅外光譜儀,主要 部件包括:光學(xué)部分、控制部分、電源適配器、筆記本電腦。儀器波長(zhǎng)范圍為 1100nm 到 2300nm, 2nm 的波長(zhǎng)增量,掃描次數(shù)為 300,采用 InGaAs 檢測(cè)器。挪威 CAMO 公司 The Unscrambler 分析軟件。

樣品:新癀片不規(guī)則顆粒狀樣品 20 個(gè),編號(hào)為 1-20,其中 1 號(hào)和 2 號(hào)樣品中的微生物 已經(jīng)殺死,為死菌體;3-20 號(hào)樣品中的微生物為活菌體。并提供每個(gè)樣品細(xì)菌數(shù)和霉菌數(shù) 的數(shù)據(jù),單位為:個(gè)/克。見(jiàn)表 1 所示。

表 1: 樣品的編號(hào)及微生物個(gè)數(shù)值

新癀片批號(hào)12345678910
細(xì)菌數(shù)(個(gè)/g)101010101010500101010
霉菌數(shù)(個(gè)/g)5010105014001630170100101050
新癀片批號(hào)11121314151617181920
細(xì)菌數(shù)(個(gè)/g)3001000500500100017001030050010
霉菌數(shù)(個(gè)/g)30101003550600250450020050100

 

1.2 實(shí)驗(yàn)方法:?

本次實(shí)驗(yàn)掃描新癀片樣品數(shù)量 20 個(gè),樣品狀態(tài)為不規(guī)則的顆粒狀。使用美國(guó) Brimrose 公司 Luminar 5030 型近紅外光譜儀采集樣品的光譜數(shù)據(jù)。將樣品放置于樣品盒的槽中,用 盒蓋將樣品刮平,連同盒蓋一起放置于支架上,光譜儀的探頭卡在樣品盒蓋的圓孔中,垂直 卡緊,采用漫反射的測(cè)樣方式采集光譜。每一張光譜都是 300 次掃描的平均結(jié)果。波長(zhǎng)范圍 從 1100nm 到 2300nm,波長(zhǎng)增量為 2nm。每個(gè)樣品均連續(xù)掃描 5 張光譜,共得到 100 張光譜。 將 100 個(gè)光譜數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)一階微分處理(9 點(diǎn)平滑),導(dǎo)入 The Unscrambler 分析軟件,然后 利用 PCA 對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算創(chuàng)建定性校正模型;將細(xì)菌數(shù)和霉菌數(shù)的數(shù)據(jù)與樣品一一對(duì) 應(yīng),采用 PLS1 方式進(jìn)行計(jì)算建立定量校正模型。

1.3 光譜及預(yù)處理

?新癀片樣品的原始吸收光譜(見(jiàn)圖 5),從圖中可以看出,所有光譜排列整齊有序,沒(méi) 有異常的樣品光譜。新癀片樣品的一階微分光譜(見(jiàn)圖 6),同樣整齊有序,有比較明顯的 吸收峰,光譜排列更加緊密,光譜與光譜之間的相似性較強(qiáng),采集到的光譜信息量大。

2.建立 PLS1 定量分析模型

2.1 模型的建立

表 1 為所提供樣品的編號(hào)及每個(gè)樣品所對(duì)應(yīng)的細(xì)菌數(shù)和霉菌數(shù)的數(shù)據(jù)。在 The Unscrambler 軟件中,將每個(gè)樣品的光譜數(shù)據(jù)與細(xì)菌和霉菌個(gè)數(shù)的數(shù)據(jù)一一對(duì)應(yīng),如圖 3 所 示。

采用偏最小二乘法(PLS1),完全交互驗(yàn)證(Full Cross Validation)的方式建立細(xì) 菌和霉菌的回歸定量分析模型。

2.2 結(jié)果分析

從圖 4 圖 5 的細(xì)菌和霉菌的回歸模型看:兩者都有很好的相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)分別為 0.9791 和 0.9895。因此,我們可以初步判斷利用近紅外光譜可以得到微生物有效的信息。 因?yàn)榻⒛P退玫臉悠窋?shù)量比較少,無(wú)法進(jìn)行未知樣品的驗(yàn)證,因此,我們用所建 立的模型對(duì)所有掃描的光譜進(jìn)行一個(gè)內(nèi)部的驗(yàn)證,所得到的結(jié)果與外部驗(yàn)證相似,可以說(shuō)明

相同的問(wèn)題。表 2 是調(diào)用模型對(duì)細(xì)菌和霉菌的一個(gè)驗(yàn)證結(jié)果:

表 2.模型對(duì)細(xì)菌和霉菌的預(yù)測(cè)結(jié)果

樣品編號(hào)細(xì)菌預(yù)測(cè)值細(xì)菌實(shí)際值霉菌預(yù)測(cè)值霉菌實(shí)際值
11231051050
12-42103350
13105106650
14171020550
15441037350
21-12110-19210
228105910
233210-1310
243410-8510
25-18710-8210
31381010861050
322141011171050
33131012551050
34-39109931050
35521011521050

 

41411016661400
42-1261015931400
43-611014071400
44-2561014091400
45-91014091400
51591014831630
52321016451630
53451014291630
54-271016521630
55-171013781630
61131084170
62-2910366170
631610388170
641410182170
6526310570170
71759500218100
72487500-709100
73704500-50100
7454850057100
75761500-311100
812111011410
樣品編號(hào)細(xì)菌預(yù)測(cè)值細(xì)菌實(shí)際值霉菌預(yù)測(cè)值霉菌實(shí)際值
823810-9710
83801037710
84-441039410
8518107810
9131064810
92-91010810
931291064610
94-2161047910
952810-5610
101-91052750
102801034050
10311010250
104510-3250
1059107050
1112353007730
1122573005230
113240300-13630
1142993005930

 

 

11528630012930
121986100029210
1221147100032410
1237121000-4710
12497510008610
1251032100023910
131450500527100
1322455009100
133414500250100
134459500171100
13553050074100
14150250025253550
142502500  
27763550
143518500  
21253550
144    
45450026263550
145500500  
24273550
1519601000  
721600
152    
7181000690600
15310361000  
690600
15410011000  
586600
樣品編號(hào)細(xì)菌預(yù)測(cè)值細(xì)菌實(shí)際值霉菌預(yù)測(cè)值霉菌實(shí)際值
15510021000615600
16116741700-334250
16217291700-163250
16316751700-284250
16417201700-226250
16515181700-381250
171851042314500
172-91043864500
173-61044244500
174341044994500
175-361044964500
181284300211200
1822833007200
183292300201200
184280300170200
185183300-147200
191471500-15750
192653500-35550
193499500-7050

 

194496500-46150
1955215007050
2017910886100
20229810984100
20322110873100
2046310714100
20523710662100

從表 2 可以看出:細(xì)菌數(shù)量大于 300 個(gè)的樣品和霉菌數(shù)量大于 600 個(gè)的樣品的模型預(yù) 測(cè)結(jié)果都接近于實(shí)際值,比較準(zhǔn)確。但是對(duì)數(shù)量比較少的樣品預(yù)測(cè)的結(jié)果差別非常大。這是 因?yàn)閮蓚€(gè)模型的數(shù)據(jù)梯度非常大,數(shù)據(jù)從幾個(gè)到幾千,在這么寬的數(shù)據(jù)范圍內(nèi),由于樣品量 有限,沒(méi)有很好的梯度間隔,而且,微生物個(gè)數(shù)少的樣品其信號(hào)反應(yīng)也相對(duì)較弱,因此,很 難預(yù)測(cè)其準(zhǔn)確的個(gè)數(shù)。

2.3 模型的改進(jìn)

針對(duì)細(xì)菌而言,如果我們的最終結(jié)果只是要求將細(xì)菌的個(gè)數(shù)控制一個(gè)數(shù)量之下,

比如少于 7000 個(gè)為合格,那么以上模型雖然對(duì)細(xì)菌少的樣品預(yù)測(cè)不夠準(zhǔn)確,但能夠達(dá)到控

制的要求。對(duì)于霉菌來(lái)說(shuō),國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)要求是少于 100 個(gè)為合格,那么我們換一個(gè)思路,用霉

菌數(shù)量少于等于 100 個(gè)的樣品建立霉菌的模型,看能夠達(dá)到什么樣的預(yù)測(cè)效果。在掃描的 100 個(gè)光譜中,霉菌數(shù)量 100 個(gè)以下的樣品的光譜個(gè)數(shù)共為 55 個(gè)。利用這 55 個(gè)光譜數(shù)據(jù)和 對(duì)應(yīng)的霉菌個(gè)數(shù)值,建立 100 個(gè)以下霉菌的模型,見(jiàn)圖 6。

從圖 6 可以看出,霉菌小范圍模型有更好的相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)達(dá)到了 0.9913,利用這個(gè)

模型對(duì)建模用的 55 個(gè)光譜進(jìn)行預(yù)測(cè),得到表 3 的結(jié)果。

 

 

 

 

表 3.霉菌 100 以下小范圍模型預(yù)測(cè)結(jié)果與實(shí)際值的比較

 

樣品

編號(hào)

預(yù)測(cè)值實(shí)際值絕對(duì)

偏差

樣品

編號(hào)

預(yù)測(cè)值實(shí)際值絕對(duì)

偏差

11505001045350-3
12465041055150-1
135450-41113230-2
144850211227303
155150-11133130-1
211210-21143630-6
221110-111530300
2391011219101
24101001221110-1
2571031231110-1
719810021241110-1
7210010001257103
73101100-11311001000
74971003132101100-1
751001000133961004
811110-1134981002
821410-4135971003
樣品

編號(hào)

預(yù)測(cè)值實(shí)際值絕對(duì)

偏差

樣品

編號(hào)

預(yù)測(cè)值實(shí)際值絕對(duì)

偏差

8391011915150-1
8461041925350-3
851210-219350500
9181021945350-3
9281021955150-1
9310100201991001
9481022021001000
957103203105100-5
1015350-3204981002
10248502205971003
1035450-4    

從表 3 可以看出:霉菌的 100 以下小范圍模型對(duì) 100 個(gè)以下的樣品預(yù)測(cè)的結(jié)果準(zhǔn)確度非 常高,只有正負(fù)幾個(gè)的絕對(duì)偏差。小范圍模型預(yù)測(cè)霉菌數(shù)量少的樣品比較準(zhǔn)確,那么預(yù)測(cè)霉 菌數(shù)量大于 100 個(gè)的樣品的結(jié)果會(huì)怎么樣?表 4 是霉菌數(shù)量大于 100 的樣品的預(yù)測(cè)結(jié)果。

表 4.小范圍模型預(yù)測(cè)霉菌數(shù)量大于 100 的樣品的結(jié)果

樣品編號(hào)預(yù)測(cè)值實(shí)際值樣品編號(hào)預(yù)測(cè)值實(shí)際值
311031050141903550
321121050142973550
3310510501431023550
341031050144903550
351071050145943550
41149140015189600
42151140015293600
43158140015390600
44149140015494600
45142140015593600
5192163016189250
5285163016289250
5391163016391250
5484163016484250
5590163016590250
61211701711064500
6215170172914500
63121701731084500
64171701741034500
樣品編號(hào)預(yù)測(cè)值實(shí)際值樣品編號(hào)預(yù)測(cè)值實(shí)際值
65131701751014500

從表 4 可以看出:霉菌數(shù)量小于 100 的樣品所建立的小范圍測(cè)試模型預(yù)測(cè)霉菌數(shù)量大 于 100 的樣品的結(jié)果與實(shí)際值相差很大,這是正常的,因?yàn)樗鶞y(cè)試的樣品范圍不在建模范圍 之內(nèi),預(yù)測(cè)的結(jié)果肯定是不準(zhǔn)確的。我們可以嘗試用霉菌的數(shù)量小于 600 個(gè)的所有樣品再建 立一個(gè)模型。在掃描的 100 個(gè)光譜中,霉菌數(shù)量小于 600 個(gè)的樣品的光譜個(gè)數(shù)共為 75 個(gè)。 利用這 75 個(gè)光譜數(shù)據(jù)和對(duì)應(yīng)的霉菌個(gè)數(shù)值,建立 600 個(gè)以下霉菌的模型,見(jiàn)圖 7。

從圖 7 可以看出,霉菌 600 個(gè)以下的模型也有很好的相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)為 0.9823,利用

這個(gè)模型對(duì)建模用的 75 個(gè)光譜進(jìn)行預(yù)測(cè),得到表 5 的結(jié)果。

表 5.霉菌 600 個(gè)以下的模型預(yù)測(cè)霉菌數(shù)量小于 600 個(gè)的樣品的結(jié)果

 

樣品編號(hào)預(yù)測(cè)值實(shí)際值樣品編號(hào)預(yù)測(cè)值實(shí)際值
1169501143230
1250501155630
134450121-210
1430501224810
155250123-7610
2118101241810
22-9210125-310
233010131111100
2471013238100
25-9610133123100
6117917013473100
樣品編號(hào)預(yù)測(cè)值實(shí)際值樣品編號(hào)預(yù)測(cè)值實(shí)際值
62189170135112100
63173170151607600
64147170152589600
65165170153597600
71190100154606600
72101100155589600
7397100161231250
7497100162246250
75147100163226250
8112410164272250
821710165247250
833110181217200
842810182131200
85-710183180200
913110184201200
921610185190200
9313101914350
94-4101924650
95-23101933650
10150501943850
10210150195-150
1037050201183100
1046950202204100

 

 

1052650203100100 
111153020495100
1125830205108100
1131030   

從表 5 可以看出:霉菌 600 個(gè)以下的模型對(duì)霉菌數(shù)量為 170、200、250、600 個(gè)的四個(gè) 樣品預(yù)測(cè)的結(jié)果準(zhǔn)確度很高;對(duì)霉菌數(shù)量 100 個(gè)以下的樣品預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度降低,但每個(gè)樣品的 平均值仍然能夠接近于實(shí)際值。

 

2.4 綜合解決方案

綜合以上的分析,在如此大的數(shù)據(jù)梯度范圍內(nèi),我們沒(méi)有辦法只用一個(gè)模型就能夠測(cè) 量準(zhǔn)確所有的樣品。但是,分析本次實(shí)驗(yàn)我們可以發(fā)現(xiàn)建立三個(gè)模型就可以準(zhǔn)確預(yù)測(cè)每一個(gè) 樣品的霉菌數(shù)量(細(xì)菌與此類(lèi)似,不再作詳細(xì)分析),這三個(gè)模型是:所有樣品參與建立的 寬數(shù)據(jù)范圍的綜合模型,我們不妨稱(chēng)其為 model-all;霉菌數(shù)量小于 600 個(gè)樣品建立的模型 稱(chēng)為 model-1000;霉菌數(shù)量小于 100 個(gè)樣品建立的小范圍模型稱(chēng)為 model-100。

分析表 2,霉菌個(gè)數(shù)在 1000 個(gè)以上的樣品預(yù)測(cè)的非常準(zhǔn)確,個(gè)數(shù)在 1000 個(gè)以下的樣品 預(yù)測(cè)值沒(méi)有超過(guò) 1000 的,因此,通過(guò) model-all 的預(yù)測(cè),可以有效地將霉菌個(gè)數(shù)在 1000 個(gè) 以上的樣品進(jìn)行準(zhǔn)確檢測(cè)。

分析表 5,利用 model-1000 模型,可以準(zhǔn)確預(yù)測(cè)霉菌數(shù)量 100 個(gè)以上的樣品。霉菌數(shù) 量 100 個(gè)以下的樣品預(yù)測(cè)不夠準(zhǔn)確。

分析表 3,利用 model-100 模型,對(duì)霉菌數(shù)量在 100 個(gè)以下的樣品預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確度非常高。

根據(jù)以上分析總結(jié),完全可以利用 AOTF-NIR 技術(shù),實(shí)現(xiàn)快速菌檢的工作。步驟如下: 掃描未知樣品的光譜,首先用 model-all 模型進(jìn)行預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)值大于 1000,那么,該樣品 的霉菌數(shù)量即為該數(shù)值;如果樣品的預(yù)測(cè)值小于 1000,用 model-1000 模型再對(duì)該樣品的光 譜進(jìn)行預(yù)測(cè),如果預(yù)測(cè)值在 200-1000 范圍之內(nèi),那么我們可以肯定該樣品的預(yù)測(cè)值為該樣

品的真實(shí)值,如果預(yù)測(cè)值在 100-200 范圍內(nèi),那么我們需要對(duì)該樣品重復(fù)掃描 5 次,用 model-1000 模型預(yù)測(cè) 5 次光譜的平均值,即為該樣品的真實(shí)值;如果用 model-1000 模型預(yù) 測(cè)該樣品光譜的預(yù)測(cè)值小于 100,那么,再調(diào)用 model-100 模型對(duì)該樣品進(jìn)行準(zhǔn)確的預(yù)測(cè), 得到的結(jié)果就是該樣品的實(shí)際值。

3.分析菌體數(shù)量是否合格

3.1 定性模型的建立

多模型分步快速菌檢法非常適合 AOTF-NIR 技術(shù)在實(shí)驗(yàn)室快速對(duì)藥品中的微生物進(jìn)行檢 測(cè),但是,該方法相對(duì)復(fù)雜,不能夠適應(yīng)在線(xiàn)的快速微生物檢測(cè),下面我們來(lái)探討一下用定 性分析的方法,能否解決在線(xiàn)菌檢的工作。

還是以霉菌為例。定性分析和定量分析是兩個(gè)不同的概念,定量分析可以檢測(cè)到一個(gè) 樣品中含有的霉菌的具體個(gè)數(shù);定性分析是判斷是與否的問(wèn)題,假設(shè)規(guī)定藥品中含有霉菌的 個(gè)數(shù)超過(guò) 100 個(gè)為不合格,少于 100 個(gè)為合格品,那么定性分析就是判斷所檢測(cè)的藥品是否 合格的問(wèn)題。

在已有的 20 個(gè)樣品中,11 個(gè)樣品的霉菌個(gè)數(shù)不超過(guò) 100,9 個(gè)樣品的霉菌個(gè)數(shù)在 100 個(gè)以上。利用主成分分析(PCA)對(duì) 11 個(gè)樣品的一階微分光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類(lèi),作為合格樣品 集;對(duì) 9 個(gè)樣品的一階微分光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類(lèi),作為不合格樣品集。因?yàn)槊總€(gè)樣品我們掃描 了 5 張光譜,我們可以將每個(gè)樣品的第一張光譜分出來(lái),作為驗(yàn)證用,其余的 4 個(gè)光譜參與 建立定性分析的模型。這樣,合格樣品集有 11 張驗(yàn)證光譜,不合格樣品集有 9 張驗(yàn)證光譜。 44 張合格品光譜建立的定性模型為 yes,36 個(gè)不合格品樣品建立的定性模型為 no,見(jiàn)圖 8 和圖 9。


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